小島 修一
こじま しゅういち
Shuichi Kojima
学習院大学理学部化学科助教授
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専門： 生命分子科学
担当講義： 生命分子科学２
住所： 〒171-8588 豊島区目白 1-5-1 学習院大学理学部
電話： 03-3986-0221（内線 6505）
fax: 03-5992-1029（理学部）
学生へ一言
生物の体内ではいろいろな現象が起きているが、それらは蛋白質や、核酸、脂質、糖質といった“生命分子”がお互いに作用し合った結果であると考えられる。そのため、生命現象をこれら生命分子の相互作用として捉え、分子レベルで理解することは重要なことである。生命分子科学とは、生命現象を分子論的に化学的な観点から明らかにしようとする研究分野である。“生命分子科学２”の授業では、生命分子のうち、物質代謝などにおいてさまざまな反応を行っている酵素や、運動、酸素運搬など、生物体内で実際に働いている機能分子である“蛋白質”を中心に取り上げる。そして、蛋白質はどのような構造をしていて、それらはどのように働いているか、ということについて、化学的な立場にたって話しを進めている。
理学部・生命分子科学研究所で実際行っている研究においても、蛋白質を主な研究対象として用いている。実際には、大腸菌などを用いて遺伝子から研究対象となる蛋白質を作らせたり、部位特異的変異法という方法を用いて人工的にアミノ酸置換を施した変異蛋白質を作成し、その変異蛋白質の機能や構造がどう変化したかを解析することにより蛋白質における構造と機能の関係について調べている。さらにこれらの結果に基づいて、天然にはない新しい構造や機能を持った蛋白質を設計し、作成しようという試みも行っている。
研究テーマ
1. 蛋白質工学の手法を用いたプロテアーゼインヒビターの構造と機能の相関関係に関する研究
対象とするインヒビター：放線菌ズブチリシンインヒビター、酵母プロテアーゼBインヒビター、ヒラタケプロテアーゼＡインヒビター、オボムコイドドメイン３ など
2. プロペプチドによるプロテアーゼの立体構造形成の分子機構に関する研究
3. αヘリックス形成ペプチドの繊維状集合体形成に関する研究
学術論文
1. T. Tobita, H. Tanaka, K. Tanaka, T. Tanaka, S. Kojima, M. Nakano
"Characteristics of Cysteinyl Sulfhydryls and Nuclease Sensitivity of Boar Sperm Nuclei during Epididymal Maturation"
Biochem. Int., 9(2), 161-168 (1984)
2. I. Kumagai, S. Kojima, E. Tamaki, K. Miura
"Conversion of Trp62 of Hen Egg-White Lysozyme to Tyr by Site-Directed Mutagenesis"
J. Biochem., 102(4), 733-740 (1987)
3. K. Miura, I. Kumagai, S. Obata, S. Kojima, S. Taguchi
"Partial Alteration of a Protein Streptomyces Subtilisin Inhibitor by Site-Directed Mutagenesis"
Proc. Japan Acad., 64B(6), 147-149 (1988)
4. S. Kojima, S. Obata, I. Kumagai, K. Miura
"Alteration of the Specificity of the Streptomyces Subtilisin Inhibitor by Gene Engineering"
Bio/Technology, 8(5), 449-452 (1990)
5. S. Kojima, I. Kumagai, K. Miura
"Effect on Inhibitory Activity of Mutation at Reaction Site P4 of the Streptomyces Subtilisin Inhibitor, SSI"
Protein Engng., 3(6), 527-530 (1990)
6. S. Kojima, Y. Nishiyama, I. Kumagai, K. Miura
"Inhibition of Subtilisin BPN' by Reaction Site P1 Mutants of Streptomyces Subtilisin Inhibitor"
J. Biochem., 109(3), 377-382 (1991)
7. A. Tamura, K. Kanaori, S. Kojima, I. Kumagai, K. Miura, K. Akasaka
"Mechanisms of Temporary Inhibition in Streptomyces Subtilisin Inhibitor Induced by an Amino Acid Substitution, Tryptophan 86 Replaced by Histidine"
Biochemistry, 30(21), 5275-5286 (1991)
8. Y. Takeuchi, S. Noguchi, Y. Satow, S. Kojima, I. Kumagai, K. Miura, K. T. Nakamura, Y. Mitsui
"Molecular Recognition at the Active Site of Subtilisin BPN': Crystallographic Studies Using Genetically Engineered Proteinaceous Inhibitor SSI (Streptomyces Subtilisin Inhibitor)"
Protein Engng., 4(5), 501-508 (1991)
9. Y. Takeuchi, T. Nonaka, K. T. Nakamura, S. Kojima, K. Miura, Y. Mitsui
"Crystal Structure of an Engineered Subtilisin Inhibitor Complexed with Bovine Trypsin"
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 89(10), 4407-4411 (1992)
10. Y. Ueda, S. Kojima, K. Tsumoto, S. Takeda, K. Miura, I. Kumagai
"A Protease Inhibitor Produced by Streptomyces lividans 66 Exhibits Inhibitory Activities toward Both Subtilisin BPN' and Trypsin"
J. Biochem., 112(2), 204-211 (1992)
11. S. Taguchi, S. Kojima, I. Kumagai, H. Ogawara, K. Miura, H. Momose
"Isolation and Partial Characterization of SSI-like Protease Inhibitors from Streptomyces"
FEMS Microbiol. Lett., 99(2/3), 293-297 (1992)
12. S. Taguchi, H. Kikuchi, S. Kojima, I. Kumagai, T. Nakase, K. Miura, H. Momose
"High Frequency of SSI-like Protease Inhibitors among Streptomyces"
Biosci. Biotech. Biochem., 57(3), 522-524 (1993)
13. S. Kojima, I. Kumagai, K. Miura
"Requirement for a Disulfide Bridge near the Reactive Site of Protease Inhibitor SSI (Streptomyces Subtilisin Inhibitor) for Its Inhibitory Action"
J. Mol. Biol., 230(2), 395-399 (1993)
14. S. Kojima, S. Furukubo, I. Kumagai, K. Miura
"Effects of Deletion in the Flexible Loop of the Protease Inhibitor SSI (Streptomyces Subtilisin Inhibitor) on Interactions with Proteases"
Protein Engng., 6(3), 297-303 (1993)
15. M. Kitamura, K. Ozawa, S. Kojima, I. Kumagai, H. Akutsu, K. Miura
"The Primary Structure of Pre-cytochrome c3 from Desulfovibrio vulgaris (Miyazaki F) as Determined by Necleotide Sequencing of Its Gene and Partial Amino Acid Sequencing"
Protein Seq. Data Anal., 5(5), 193-196 (1993)
16. K. Masuda-Momma, T. Hatanaka, K. Inouye, K. Kanaori, A. Tamura, K. Akasaka, S. Kojima, I. Kumagai, K. Miura, B. Tonomura
"Interaction of Subtilisin BPN' and Recombinant Streptomyces Subtilisin Inhibitors with Substituted P1 Site Residues"
J. Biochem., 114(4), 553-559 (1993)
17. T. Kumazaki, K. Kajiwara, S. Kojima, K. Miura, S. Ishii
"Interaction of Streptomyces Subtilisin Inhibitor (SSI) with Streptomyces griseus Metallo-Endopeptidase II (SGMP II)"
J. Biochem., 114(4), 570-575 (1993)
18. M. Matsubara, E. Kurimoto, S. Kojima, K. Miura, T. Sakai
"Quantitative in vitro Renaturation of Subtilisin BPN' without the Aid of Pro-sequence"
Chem. Lett., 1993(10), 1783-1786 (1993)
19. K. Masuda-Momma, T. Shimakawa, K. Inouye, K. Hiromi, S. Kojima, I. Kumagai, K. Miura, B. Tonomura
"Identification of Amino Acid Residues Responsible for the Changes of Absorption and Fluorescence Spectra on the Binding of Subtilisin BPN' and Streptomyces Subtilisin Inhibitor"
J. Biochem., 114(6), 906-911 (1993)
20. S. Taguchi, H. Kikuchi, M. Suzuki, S. Kojima, M. Terabe, K. Miura, T. Nakase, H. Momose
"Streptomyces Subtilisin Inhibitor-Like Proteins Are Distributed Widely in Streptomycetes"
Appl. Environ. Microbiol., 59(12), 4338-4341 (1993)
21. S. Kojima, K. Fujimura, I. Kumagai, K. Miura
"Contribution of Salt Bridge in the Protease Inhibitor SSI (Streptomyces Subtilisin Inhibitor) to Its Inhibitory Action"
FEBS Lett., 337(2), 195-199 (1994)
22. M. Kitamura, S. Kojima, K. Ogasawara, T. Nakaya, T. Sagara, K. Niki, K. Miura, H. Akutsu, I. Kumagai
"Novel FMN-Binding Protein from Desulfovibrio vulgaris (Miyazaki F)--Cloning and Expression of Its Gene in Escherichia coli"
J. Biol., Chem., 269(8), 5566-5573 (1994)
23. K. Akama, S. Kojima, M. Nakano, T. Tobita, H. Hayashi
"The Amino Acid Sequence and Phosphorylation Sites of a Boar Transition Protein 1"
Biochem. Mol. Biol. Int., 32(2), 349-357 (1994)
24. S. Taguchi. S. Kojima, M. Terabe, K. Miura, H. Momose
"Comparative Studies on the Primary Structures and Inhibitory Properties of Subtilisin-Trypsin Inhibitors from Streptomyces"
Eur. J. Biochem., 220(3), 911-918 (1994)
25. M. Matsubara, E. Kurimoto, S. Kojima, K. Miura, T. Sakai
"Achievement of Renaturation of Subtilisin BPN' by a Novel Procedure Using Organic Salts and a Digestible Mutant of Streptomyces Subtilisin Inhibitor"
FEBS Lett., 342(2), 193-196 (1994)
26. T. Tange, S. Taguchi, S. Kojima, K. Miura, H. Momose
"Improvement of a Useful Enzyme (Subtilisin BPN') by an Experimental Evolution System"
Appl. Environ. Microbiol., 41(2), 239-244 (1994)
27. S. Kojima, N. Fushimi, A. Ikeda, I. Kumagai, K. Miura
"Secretory Production of Chicken Ovomucoid Domain 3 by Escherichia coli and Alteration of Inhibitory Specificity toward Proteases by Substitution of the P1 Site Residue"
Gene, 143(2), 239-243 (1994)
28. S. Kojima, M. Terabe, S. Taguchi, H. Momose, K. Miura
"Primary Structure and Inhibitory Properties of a Proteinase Inhibitor Produced by Streptomyces cacaoi"
Biochim. Biophys. Acta, 1207(1), 120-125 (1994)
29. T. Hayashi, M. Matsubara, D. Nohara, S. Kojima, K. Miura, T. Sakai
"Renaturation of the Mature Subtilisin BPN' Immobilized on Agarose Beads"
FEBS Lett., 350(1), 109-112 (1994)
30. M. Terabe, S. Kojima, S. Taguchi, H. Momose, K. Miura
"Three Novel Subtilisin-Trypsin Inhibitors from Streptomyces: Primary Structures and Inhibitory Properties"
J. Biochem., 116(5), 1156-1163 (1994)
31. M. Terabe, S. Kojima, S. Taguchi, H. Momose, K. Miura
"Primary Structure and Inhibitory Properties of a Subtilisin-Chymotrypsin Inhibitor from Streptomyces virginiae"
Eur. J. Biochem., 226(2), 627-632 (1994)
32. A. Tamura, S. Kojima, K. Miura, J. M. Sturtevant
"Effect of an Intersubunit Disulfide Bond on the Stability of Streptomyces Subtilisin Inhibitor"
Biochemistry, 33(48), 14512-14520 (1994)
33. M. Terabe, S. Kojima, S. Taguchi, H. Momose, K. Miura
"A Subtilisin Inhibitor Produced by Streptomyces bikiniensis Possesses a Glutamine Residue at Reactive Site P1"
J. Biochem., 117(3), 609-613 (1995)
34. A. Tamura, S. Kojima, K. Miura, J. M. Sturtevant
"A Thermodynamic Study of Mutant Forms of Streptomyces Subtilisin Inhibitor. II. Replacements at the Interface of Dimer Formation, Val13"
J. Mol. Biol., 249(3), 636-645 (1995)
35. K. Akama, H. Ichimura, H. Sato, S. Kojima, K. Miura, H. Hayashi, Y. Komatsu, M. Nakano
"The Amino Acid Sequence and Interaction with the Nucleosome Core DNA of Transition Protein 4 from Boar Late Spermatid Nuclei"
Eur. J. Biochem., 233(1), 179-185 (1995)
36. S. Taguchi, M. Suzuki, S. Kojima, K. Miura, H. Momose
"Streptomyces Serine Protease (SAM-P20): Recombinant Production, Characterization, and Interaction with Endogenous Protease Inhibitor"
J. Bacteriol., 177(22), 6638-6643 (1995)
37. S. Taguchi, S. Kojima, K. Miura, H. Momose
"Taxonomic Characterization of Closely Related Streptomyces spp. Based on the Amino Acid Sequence Analysis of Protease Inhibitor Proteins"
FEMS Microbiol. Lett., 135(2/3), 169-173 (1996)
38. A. Tamura, M. Matsushita, A. Naito, S. Kojima, K. Miura, K. Akasaka
"Dynamics of the Three Methionyl Side Chains of Streptomyces Subtilisin Inhibitor. Deuterium NMR Studies in Solution and in the Solid State"
Protein Sci., 5(1), 127-139 (1996)
39. M. Terabe, S. Kojima, S. Taguchi, H. Momose, K. Miura
"New Subtilisin-Trypsin Inhibitors Produced by Streptomyces: Primary Structures and Their Relationship to Other Proteinase Inhibitors from Streptomyces"
Biochim. Biophys. Acta, 1292(2), 233-240 (1996)
40. S. Kojima, Y. Kuriki, Y. Sato, F. Arisaka, I. Kumagai, S. Takahashi, K. Miura
"Synthesis of α-Helix-Forming Peptides by Gene Engineering Methods and Their Characterization by Circular Dichroism Spectra Measurements"
Biochim. Biophys. Acta, 1294(2), 129-137 (1996)
41. S. Kojima, K. Miyoshi, K. Miura
"Synthesis of a Squash-Type Protease Inhibitor by Gene Engineering and Effects of Replacements of Conserved Hydrophobic Amino Acid Residues on Its Inhibitory Activity"
Protein Engng., 9(12), 1241-1246 (1996)
42. M. Suzuki, S. Taguchi, S. Yamada, S. Kojima, K. Miura, H. Momose
"A Novel Member of the Subtilisin-Like Protease Family from Streptomyces albogriseolus"
J. Bacteriol., 179(2), 430-438 (1997)
43. S. Kojima, Y. Kuriki, T. Yoshida, K. Yazaki, K. Miura
"Fibril Formation by an Amphipathic α-Helix-Forming Polypeptide Produced by Gene Engineering"
Proc. Japan Acad., 73B(1), 7-11 (1997)
44. M. Kitamura, Y. Koshino, Y. Kamikawa, K. Kohno, S. Kojima, K. Miura, T. Sagara, H. Akutsu, I. Kumagai, T. Nakaya
"Cloning and Expression of the Rubredoxin Gene from Desulfovibrio vulgaris (Miyazaki F)--Comparison of the Primary Structure of Desulfoferrodoxin"
Biochim. Biophys. Acta, 1351(1/2), 239-247 (1997)
45. S. Taguchi, S. Kojima, M. Terabe, Y. Kumazawa, H. Kohriyama, M. Suzuki, K. Miura, H. Momose
"Molecular Phylogenetic Characterization of Streptomyces Protease Inhibitor Family"
J. Mol. Evol., 44(5), 542-551 (1997)
46. M. Wakiyama, N. Sakai, S. Kojima, K. Miura
"Disulfide Bond Formation Is Not Involved in Cap-Binding Activity of Xenopus Translation Initiation Factor eIF-4E"
FEBS Lett., 409(3), 407-410 (1997)
47. S. Kojima, T. Minagawa, K. Miura
"The Propeptide of Subtilisin BPN' as a Temporary Inhibitor and Effect of an Amino Acid Replacement on Its Inhibitory Activity"
FEBS Lett., 411(1), 128-132 (1997)
48. S. Kojima, T. Minagawa, K. Miura
"Tertiary Structure Formation in the Propeptide of Subtilisin BPN' by Successive Amino Acid Replacements and Its Close Relation to Function"
J. Mol. Biol., 277(5), 1007-1013 (1998)
49. M. Kitamura, T. Sagara, M. Taniguchi, M. Ashida, K. Ezoe, K. Kohno, S. Kojima, K. Ozawa, H. Akutsu, I. Kumagai, T. Nakaya
"Cloning and Expression of the Gene Encoding Flavodoxin from Desulfovibrio vulgaris (Miyazaki F)"
J. Biochem., 123(5), 891-898 (1998)
50. S. Kojima, T. Kumazaki, S. Ishii, K. Miura
"Primary Structure of Streptomyces griseus Metalloendopeptidase II"
Biosci. Biotech. Biochem., 62(7), 1392-1398 (1998)
51. S. Taguchi, S. Yamada, S. Kojima, H. Momose
"An Endogenous Target Protease, SAM-P26, of Streptomyces Protease Inhibitor (SSI): Primary Structure, Enzymatic Characterization, and Its Interaction with SSI"
J. Biochem., 124(4), 804-810 (1998)
52. T. Tanaka, H. Matsuzawa, S. Kojima, I. Kumagai, K. Miura, T. Ohta
"P1-Specificity of Aqualysin I (a Subtilisin-Type Serine Protease) from Thermus aquaticus YT-1, Using P1-Substituted Derivatives of Streptomyces Subtilisin Inhibitor"
Biosci. Biotech. Biochem., 62(10), 2035-2038 (1998)
53. D. Nohara, H. Sugiura, H. Sakakibara, M. Matsubara, S. Kojima, K. Miura, T. Sakai
"High Performance in Refolding of Streptomyces griseus Trypsin by the Aid of a Mutant of Streptomyces Subtilisin Inhibitor Designed as Trypsin Inhibitor"
J. Biochem., 125(2), 343-347 (1999)
54. S. Kojima, M. Deguchi, K. Miura
"Involvement of the C-Terminal Region of Yeast Proteinase B Inhibitor 2 in Its Inhibitory Action"
J. Mol. Biol., 286(3), 775-785 (1999)
55. H. Sato, K. Akama, S. Kojima, K. Miura, A. Sekine, M. Nakano
"Expression of a Zinc-Binding Domain of Boar Spermatidal Transition Protein 2 in Escherichia coli"
Protein Express. Purif., 16 (1999) in press
56. S. Kojima, N. Takagi, T. Minagawa, N. Fushimi, K. Miura
"Effects of Amino Acid Replacements around the Reactive Site of Chicken Ovomucoid Domain 3 on the Inhibitory Activity toward Chymotrypsin and Trypsin"
Protein Engng., 12(10) (1999) in press
英文著書
1. Protein Engineering (M. Ikehara, ed.)
Y. Takeuchi, S. Noguchi, Y. Satow, S. Kojima, I. Kumagai, K. Miura, Y. Mitsui
"Molecular Recognition at the Interface between Subtilisin BPN' and Its Proteinaceous Inhibitor SSI" pp103-108
S. Kojima, S. Furukubo, Y. Nishiyama, K. Fujimura, I. Kumagai, K. Miura
"Alteration of the Functional Structure of the Protease Inhibitor, Streptomyces Subtilisin Inhibitor by Site-Directed Mutagenesis" pp147-152
(Japan Scientific Society Press & Springer-Verlag, 1990)
邦文著書・総説
1. 小島修一、三浦謹一郎
最近のタンパク質工学のトピックス
化学、42(12)、850-851 (1987)
2. 小島修一、熊谷 泉
新・酵素利用技術 （相沢益男編）
メディカル編、第２章、酵素阻害剤、24-41頁
（シーエムシー、1988年3月）
3. 小島修一
トピックス サブチリシンの基質補助触媒作用(Substrate-Assisted Catalysis)
化学と工業、41(7)、678-689 (1988)
4. 小島修一、三浦謹一郎
プロテアーゼ・インヒビターの人為的改変と分子進化
遺伝、42(12)、13-17 (1988)
5. 小島修一、熊谷 泉、三浦謹一郎
放線菌サブチリシンインヒビターの蛋白質工学
蛋白質核酸酵素、34(8)、939-948 (1989)
6. プロテインエンジニアリング II （渡辺公綱、熊谷 泉編）
小島修一、熊谷 泉
第１編 タンパク質改変諸例
第４章 その他のタンパク質の機能改変--プロテアーゼインヒビター、99-111頁
小島修一、北村昌也
付表 タンパク質・核酸改変データ、169-232頁
（シーエムシー、1990年3月）
7. 小島修一、熊谷 泉、三浦謹一郎
現代化学・増刊19 プロテインエンジニアリング （三浦謹一郎編）
８. プロテアーゼインヒビターＳＳＩ、74-83頁
（東京化学同人、1990年9月）
8. 甲斐荘正恒、安倍未央、三宅洋子、小島修一
蛋白質核酸酵素・臨時増刊 蛋白質工学の進展--蛋白質の設計をめざして
（三浦謹一郎、京極好正、菊池正和、松浦良樹編）
蛋白質の安定同位体利用ＮＭＲスペクトル、465-479頁
（共立出版、1992年2月）
9. 小島修一
バイオテクノロジー基礎講座 第２分冊 バイオテクノロジーの原理と応用
（太田次郎、百瀬春生編）
第４週 タンパク質工学、75-100頁
（工学研究社、1992年10月）
10. 小島修一、三浦謹一郎
新生化学実験講座 第１巻 タンパク質 VII タンパク質工学 （日本生化学会編）
8. 研究例 8・１ ズブチリシンインヒビター、355-372頁
（東京化学同人、1993年2月）
11. 小島修一
精製分離技術ハンドブック（日本化学会編）
II 編 応用編 13 バイオサイエンス
13.7.5 遺伝子産物の分離精製、717-726頁
13.7.6 ＤＮＡの構造解析、726-731頁
（丸善、1993年3月）
12. 小島修一
分子生物学（放送大学印刷教材、三浦謹一郎編）
13章 タンパク質の構造と機能（１） 基礎 181-195頁
14章 タンパク質の構造と機能（２） タンパク質工学 196-209頁
（日本放送出版協会、1993年3月）
13. 小島修一、三浦謹一郎
蛋白質核酸酵素・臨時増刊 蛋白質の時代--構造・物性・機能研究の新局面
（郷 信広、大島泰郎、油谷克英、猪飼 篤編）
プロテアーゼの機能変換とプロテアーゼ・インヒビターの阻害機構、1111-1120頁
（共立出版、1994年5月）
14. 渡辺公綱、小島修一
バイオテクノロジー教科書シリーズ9
蛋白質工学概論
（コロナ社、1995年７月）
15. 小島修一
シリーズ分子生物学６ 構造生物学 （三浦謹一郎編）
4. タンパク質の多彩な機能と構造の関係
4.6 プロテアーゼとインヒビター、131-144頁
（朝倉書店、1998年1月）
16. 小島修一
プロテアーゼのプロペプチドの二面性：インヒビターおよび分子シャペロン
バイオサイエンスとインダストリー、56(5)、327-328 (1998)
Last modified: August 30, 1999
小島修一
学習院大学理学部化学科
Shuichi Kojima
Department of Chemistry, Gakushuin Univeristy
Tokyo, Japan
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